Weil die ganze Naboo-Geschichte auf Sidious' Mist gewachsen ist, der Gunray (zumindest lt. altem EU) erpresste, damit dieser die Belagerung/Besetzung überhaupt in die Gänge leitet.
Mit Krieg wollte die Handelsföderation, deren Arsenal in erster Linie dafür bestimmt war, ihre eigenen Transporte/Konvois vor Überfällen auf irgendwelchen entlegenen Routen zu schützen, nichts zu tun haben. Ihre Agenda war - ebenso wie bei (fast?) allen anderen Fraktionen der CIS, die uns in AOTC als Wirtschaftstreibende und Banken vorgestellt werden - eher wirtschaftlicher denn politischer Natur.