Ich denke mir das wie folgt:
Palpatine hatte auch hier wieder seine Finger im Spiel und hat der Blockadeflotte befohlen, andere Positionen einzunehmen, damit nicht nochmal jemand abhauen kann - vielleicht hat die Handelsföderation auch einige ausgeschickt, um Amidala zu suchen und VOR Maul zu finden, aber das ist nun genauso Theorie wie der Rest in meinem Posting^^ -
So kam unser Nabooschiff auf den Planeten zurück. Vielleicht hat man sie auch durchgelassen, weil man geglaubt hat, dass sie diesmal nicht entkommen könnte, wenn sie sich bereits auf dem Planeten befindet.
So, als jetzt die "große" Raumschlacht began sind alle Mitglieder der Handelsföderation davon ausgegangen, dass der Schild völlig undurchdringlisch (wie der eine so schön sagte) ist und sind daher nicht hingeilt, um das Kontrollschiff zu schützen. Nun haben auch die Besatzungen der anderen Schiffe (welche man halt einfach nicht sehen konnte, oder?) mitbekommen, dass ein Schiff mit "völlig undurchdringlichen" Schilden, welches "zufällig" auch noch das Kontrollschiff war, vernichtet worden ist und sind in Panik geraten...zum ersten haben die Schiffe urplötzlich keine so wirklich funktionierenden Kampfdroiden mehr an Bord, denke ich und zum anderen war die Vernichtung des Kontrollschiffes schon ein moralischer Schlag, weil man wie schon gesagt davon ausgegangen ist, dass die Schilde undurchdringlisch sind. Und es scheint mir irgendwie typisch, dass Neimodianer (gehe mal davon aus, dass auch die anderen Schiffe von solchen Befehligt wurden) dann lieber fliehen, ehe sie mit ihrem eigenen Schiff zerfetzt werden.