Wobei es noch weitere - meines Erachtens auch aussagekräftigere - Indizien dafür gibt, dass Jon von Lyanna und Rhaegar abstammt, als die Dracheneier.
Für mich persönlich ist da immer noch die Befreiung von Lyanna aus dem Turm der Freude schon fast ein Beweis für die Theorie.
Zum einen findet Ned Lyanna dort in einem "Bett aus Blut" vor, was man als "kurz nach der Entbindung" deuten kann (hierzu ist anzumerken, dass die Befreiung etwas weniger als ein Jahr nach dem Turnier auf Harrenhall stattfindet, bei welchem Rhaegar für einen Skandal sorgte, indem er die zu dem Zeitpunkt bereits mit Robert verlobte Lyanna und nicht seine anwesende Ehefrau Elia zur "Königin der Liebe und der Schönheit" krönte, das würde also auch zeitlich passen). Weiterhin wurde der Turm der Freude von drei Mitgliedern der Königsgarde, unter anderem dem Lord Kommandanten, bewacht. Deren Anwesenheit ergibt eigentlich nur Sinn, wenn sich im Turm ein Mitglied der Königsfamilie aufhalten würde. Allerdings gehört Lyanna nicht zu dieser und alle bekannten Targaryen sind entweder in Königsmund oder anderswo.
Daneben gibt es auch noch andere Kleinigkeiten, die auf einen Wahrheitsgehalt der Theorie hindeuten. Beispielsweise scheint Jon Arya recht ähnlich zu sehen, von der es wiederum heißt, dass die Lyanna ähnlich sähe.
Meines Wissens nach wurde durch die Serie die Theorie auch bestätigt, allerdings bin ich noch nicht soweit. Da bin ich immer noch nicht mal bei der Roten Hochzeit.